La Dirección de Estudios organiza convivencias de estudio en casas rurales cercanas para facilitar una mayor concentración y aprovechamiento de los participantes. El horario de las convivencias lo llena fundamentalmente el estudio personal junto con seminarios de resolución de dudas.

A lo largo del año han tenido lugar más de veinte seminarios sobre distintas asignaturas. En ellos se explican algunos temas especialmente complicados. Han sido impartidos por profesores y estudiantes de últimos cursos.

La actividad fundamental de la dirección de estudios son las tutorías personales. En ellas, los residentes por medio de entrevistas personales reciben asesoramiento personalizado. Se establece un plan de trabajo que va ayudando a los colegiales a estudiar mejor, aprender a plantear los exámenes, enfocar de forma distinta cada asignatura, planificar su carrera académica, etc.

El solemne Acto de Apertura de Curso tuvo lugar el día 7 de octubre de 2006 y estuvo presidido por D. José María Bastero de Eleizalde, Vicerrector de Investigación de la Universidad de Navarra, en representación del Rector Magnífico.